Les Halogaridaceae, généralement classées parmis les Myrtales, et sont divisées en deux sous-familles.
 
La sous-famille des 
Halogaroideae a un ovaire à 2-4 loges, des feuilles dépourvues de stipules, des inflorescences de petite taille, un fruit sec et des pétales pouvant être absents. On y distingue deux tribus : les 
Halogareae ont des fruits indéhiscents (
Loudonia, Meziella, Halogaris, Laurembergia, Proserpinaca), et les 
Myriophylleae qui ont des fruits se séparant en 2-4 nucules (
Myriophyllum).
 
La sous-famille des 
Gunneroideae, parfois individualisées comme Gunneraceae, a un ovaire uniloculaire, des feuilles stipulées, des inflorescences de grande taille et des pétales absents. Le seul genre est 
Gunnera. Les Gunneroideae sont proches des 
Hippuridaceae, et ont quelquefois été incluses dans la même famille, de même que les 
Callitrichaceae. Leurs caractéristiques florales les rapproches des 
Onagraceae, mais les liens sont peu clairs.
Le genre australien 
Glischrocaryon combine les caractères des deux sous familles.