Les Empetraceae sont proches des
Ericaceae, car elles possèdent toutes les deux des caractères embryologiques bien marqués, des composants chimiques identiques, ainsi qu'un port et une morphologie semblables. Certaines classifications fusionnent d'ailleurs les deux familles. Des études moléculaires et palynologiques ont montré que les Empetraceae étaient particulièrement proches de la sous-famille des Ercoideae.
Les 3 genres se distinguent de la façon suivante :
Empetrum a des fleurs solitaires à l'aisselle des feuilles et 3 étamines.
Ceratiola a 2-3 fleurs à l'aisselle des feuilles et 2 étamines.
Corema a des fleurs groupées en capitules terminales et 3-4 étamines. Tous les genres sont diploïdes, sauf
Empetrum qui possède des espèces tétraploïdes. Les genres diploïdes, ancestraux, possèdent des fleurs mâles et femelles distinctes. Les fleurs unisexuées et/ou les fleurs bisexuées sur une même plante en sont une situation dérivée.