L'inflorescence, terminale, axillaire ou opposée aux feuilles, est habituellement une grappe, mais on trouve aussi des thyrses et des corymbes, et parfois, les fleurs sont solitaires.
Les fleurs ont une structure complexe et inhabituelle dérivée des espèces les plus primitives de
Papaveracées : elles ont une symétrie bilatérale suivant un plan, ou suivant deux plans perpendiculaires.
Généralement, le périanthe se compose de 2 sépales caducs ou persistants, et de 4 pétales libres ou plus ou moins connés, disposés sur 2 verticilles de 2 pièces chacuns. Les deux pétales externes peuvent entre similaires ou non, les internes étant similaires et connés apicalement.
Il y a généralement 6 étamines disposés en 2 groupes de 3, opposés aux pétales externes, les filets de chaque groupe pouvant être plus ou moins connés entre eux ou avec la base des pétales, et posséder des glandes nectarifères basales (
Pteridophyllum). Les anthères sont conniventes et adhèrent au stigmate ; elles sont biloculaires, ou uniloculaires pour les étamines latérales chez certains genres.
L'ovaire est supère, uniloculaire, composé de 2 carpelles entièrement soudés, à placentation pariétale, contenant généralement de nombreux ovules, sauf chez les
Fumaria et genres alliés ou l'ovule est unique.
Dans les cas les plus simples (
Pteridophyllum), il y a 2 petits sépales, 4 pétales, les 2 internes étant plus larges que les 2 externes, et seulement 4 étamines. Chez
Hypecoum, les 2 pétales internes ont 3 lobes proéminents ; le lobe du milieu, pédonculé, a un apex en forme de coupe entourant les anthères pour former une cavité recueillant le pollen, et les étamines sont aussi seulement au nombre de 4.
Chez
Dicentra la structure est encore plus élaborée : les 4 pétales sont diversement soudés, particulièrement vers l'apex, et les pétales externes sont munis d'un éperon à la base, les apex des pétales internes étant soudés autour des anthères. Les étamines sont disposées en 2 faisceaux opposés aux pétales internes, chacun possédant un filet unique qui se divise en 3 parties au niveau de l'apex. Chaque division centrale porte une anthère, les divisions latérales portant seulement la moitié d'une anthère chacune. La base de chaque filet se prolonge dans l'eperon et y sécréte du nectar.
Chez les autres genres, un seul des pétales externes est muni d?un éperon, formant alors une fleur irrégulière très inhabituelle. Tous ces genres ont des étamines disposées comme
Dicentra.
Le fruit est généralement une capsule parfois renflée comme une outre, à dehiscence valvaire. Il peut aussi être indéhiscent, ou encore être une nucule à une graine, ou à plusieurs graines mais divisée en segments monospermes indéhiscents.
Ceratocapnos heterocarpa possède des fruits dimorphiques. La graine a un petit embryon et un albumen charnu, et possède fréquemment un élaiosome.