La famille est très caractérisée et les opinions diffèrent pour reconnaître ses parentés taxinomiques. Les groupes voisins les plus fréquemment proposés sont les 
Monimiaceae et les 
Annonaceae ; ces deux familles comportant des arbres de foret tropicale humide aux feuilles aromatiques. Les Myristicaceae achèvent la contraction de la fleur, déjà nettement marquée chez les 
Lauraceae.
Pendant longtemps, les membres de cette famille furent classés dans le genre unique 
Myristica, probablement parce que la fleur femelle et le fruit sont homogènes. Une étude ultérieure plus détaillée entraîna sa division en de nombreux genres, et entre 16 et 19 sont aujourd'hui reconnus, incluant 
Kneama, 
Virola, 
Pycnanthus et 
Horsfielda. Tous les genres sont principalement séparés par des différences de structure dans la colonne staminale, l'arille et l'inflorescence.